随着鄯善县经济的快速发展，各行业需水量不断增加，水资源供需矛盾日益突出。该县水资源总量为3.4亿立方，人均水资源占有量仅为1187立方，远低于全疆平均水平。而每年实际用水量5亿立方，地下水严重超采，造成地下水位的持续下降，火焰山以北（简称山北）平均每年下降0.45米
，火焰山以南（简称山南）平均每年下降1.37米。经勘测山南片区的地下水层可知，山南片区处于吐鲁番盆地边沿，地下含水层220米左右，目前，山南片区打井已经达到200米左右，若不采取措施，地下水位持续下降，10年内山南片区将出现撂荒和整体搬迁的结局。
而鄯善县有限的水资源几乎全部被农业和农村占用，农业用水达到93%，对全县GDP的贡献不足5%；工业用水不足5%，对全县GDP的贡献达95%。很明显，这种不科学的农业开发行为，不得不以每年超采1.6亿多方地下水的代价，来维系着农业经济的缓慢增长，使得本来就不充裕的水资源更加稀缺。为确保吐鲁番地区经济社会的可持续发展，进一步推进退耕还水步伐，维持水资源平衡，在地委全委（扩大）会议上，该地区提出了"以增加农民收入为切入点，加快调整农业内部种植结构，逐步减少农民的数量，实现农民收入多元化。进一步优化水资源配置，协调农业、工业、城市和生态用水比例，构筑与水资源承载能力相适应的循环经济体系"的发展思路和"强农、兴工、促旅、活水、宜居、育人"的发展战略。鄯善县要"兴工"必先"强农"，"强农"首先"活水"，只有把农业推向现代化，才可能把水节约出来搞工业，"活水"是工业和农业可持续发展的战略举措。通过发展高效节水设施农业，逐渐使鄯善县以农业为主的经济形态向以工业为主的经济形态转变，以工业反哺农业。试验证明，设施农业的节水率可达70%。因此，设施农业是鄯善县农业内部结构调整的必选之路，也是解决该县水资源瓶颈，确保工农业持续平衡发展的最佳途径。（